雷霆战舰的海员系统也是一个亮点。通过为战舰增加海员来增加战舰的属性和战斗力。
海员的获得同样是来自于军校的海员招募，通过刷新来获得想要的海员。军校每天会自动刷新一次海员。
每个舰长可以带领6个海员，分别为火控手（攻），轮机员（防），炮术员（暴），观测员（命中），损管员（抗暴），舵手（闪避）。每个海员只能上任到固定舱位。海员按品质也分5级，S级海员可以胜任任意舱位。
海员可以升级的，通过金币为海员进行升级，但是海员的等级不能超过玩家的等级。
海员的加成是不同的只有S级海员是有攻击 、暴击和命中属性，其他品级的只有攻击这一个属性，随着海员的等级提升，他们自带的属性也会随等级的提升而提升，进而强化战舰的属性。
战舰的海员会随着人物的等级而开放，当达到25级时所有的海员位置会全部开放。配置海员来提升战舰的战斗力是个不错的选择。