在《幻卡骑士团》里面，每章地图完成一半左右的进度就会出现地图副本，地图副本共5层，越往上走敌方的实力越强，顶层甚至会出现S级的敌人。每层第一次挑战消耗10点体力，相应的胜利后得到的经验和金币也是平时的5倍；而挑战失败后再次挑战只消耗2点体力。
副本那么艰难为什么玩家还要积极去挑战呢？答案只有一个！！！
副本有概率出现超强的【S级】卡牌哦！而且还是抽晶钻包都无法得到的【S级】卡牌。
虽然【S级】卡牌之间不好说谁强谁弱，但是某些情况下，副本里的【S级】卡牌甚至比晶钻包抽到的更好用，所以这种每天都可以挑战的机会大家千万不要放弃~
每个副本原则上只能挑战一次，每天0点会准时刷新，刷新的概念就是不管你当前在第几层，都会清零。所以玩家一定要记得每天把正在挑战的副本打通，不然损失很大。（此外，100晶钻可以重置一次副本。）